主要来自于粪便的分解。氨易溶于水，在猪舍中氨常被溶解或吸附在潮湿的地面、墙壁和猪黏膜上。氨能刺激黏膜，引起黏膜充血、喉头水肿、支气管炎，严重时引起肺水肿、肺出血;氨还能引起中枢神经系统麻痹、中毒性肝病等。在低浓度氨的长期作用下，猪体质变弱，对某些疾病产生敏感，采食量、日增重、生殖能力都下降，这种症状称为“氨的慢性中毒”。若氨浓度较高，对猪引起明显病理反应和症状，称为“氨中毒”。试验表明，猪的生产性能在空气中氨的体积浓度达到0.005%(50毫升/立方米)时开始受到影响，0.01%时食欲降低和易起各种呼吸道疾病，0.03%时引起呼吸变浅和痉挛。猪舍氨含量一般应控制在0.003%以内。
二氧化碳：
主要来源是舍内猪的呼吸。1头体重100公斤的肥猪，每小时可呼出二氧化碳43升，因此猪舍内二氧化碳含量往往比大气中高出许多倍。二氧化碳本身无毒性，它的危害主要是造成缺氧，引起慢性毒害。猪长期处在缺氧的环境中会精神委靡，食欲减退，体质下降，生产力降低，对疾病的抵抗力减弱，特别易于感染结核病等传染病。猪舍内二氧化碳体积浓度不应超过0.15%。虽然二氧化碳本身不会引起猪中毒，但二氧化碳浓度的卫生意义在于，它能表明猪舍空气的污浊程度，亦表明舍内空气中可能存在其他有害气体的多少。因此二氧化碳浓度可作为猪舍卫生评定的一项间接指标。
一氧化碳：
为无色、无味的气体，猪舍中一般没有多少一氧化碳。当冬季在密闭的猪舍内生火取暖时，若燃料燃烧不完全，会产生大量一氧化碳。一氧化碳对血液、神经系统具有毒害作用。它通过肺泡进入血液循环，与血红蛋白结合形成相对稳定的碳氧基血红蛋白，这种血红蛋白不易解离，不仅减少了血细胞的携氧功能，还抑制和减缓氧合血红蛋白的解离与氧的释放，造成机体急性缺氧，发生血管和神经细胞的机能障碍，出现呼吸、循环和神经系统的病变。碳氧基血红蛋白的解离要比氧合血红蛋白慢3600倍，因此中毒后有持久的毒害作用。当一氧化碳浓度在0.05%时，经短时间就可引起急性中毒。猪舍内一氧化碳浓度应低于0.0025%。
硫化氢：
是一种无色、易挥发的恶臭气体，在猪舍中主要由含硫物分解而来。硫化氢产生自猪舍地面，且比重较大，故愈接近地面，浓度愈大。硫化氢主要刺激黏膜，引起眼结膜炎、鼻炎、气管炎，以至肺水肿。经常吸入低浓度硫化氢可出现植物性神经紊乱。游离在血液中的硫化氢，能和氧化型细胞色素氧化酶中的三价铁结合，使酶失去活性，以致影响细胞的氧化过程，造成组织缺氧。长期处在低浓度硫化氢的环境中，猪体质变弱，抗病力下降。高浓度的硫化氢可直接抑制呼吸中枢，引起窒息和死亡。当硫化氢浓度达到0.002%，会影响猪的食欲。猪舍内硫化氨浓度不应超过 0.001%。
