《饲料卫生标准》至今只更新过2次，现行版本是第2版，由国家质检总局2001年发布，包括4个系列标准《饲料卫生标准 饲料中 亚硝酸盐允许量》，《饲料卫生标准 饲料中 赭曲霉毒素A和 玉米赤霉烯酮的允许量》，《配合饲料中 脱氧雪服镰刀菌烯醇的允许量》，《配合饲料中 T-2毒素的允许量》。
现行《饲料卫生标准》已执行13年，随着行业的发展进步，新品种的增加等原因，全国饲料工业标准化技术委员会主任委员沙玉圣在2016饲料行业技术交流会议上讲解了即将颁布的新的《饲料卫生标准》的修改内容，此次修改包含以下几个方面：
1、拓展了标准对于饲料原料和饲料产品的覆盖范围
2、适用范围中删除了饲料添加剂，其卫生指标将在产品标准中规定
4、增补了污染物的控制项目
5、更新了检测方法
6、修订了部分限量指标
7、调整了列式方式
